Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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