Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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MRPL28Q13084 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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