Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms