Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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NFX1Q12986 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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