Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
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