Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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FOXD4Q12950 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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FOXD4Q12950 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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FOXD4Q12950 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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FOXD4Q12950 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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FOXD4Q12950 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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