Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
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TWF1Q12792 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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TWF1Q12792 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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TWF1Q12792 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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TWF1Q12792 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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TWF1Q12792 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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TWF1Q12792 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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TWF1Q12792 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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TWF1Q12792 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
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TWF1Q12792 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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TWF1Q12792 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
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TWF1Q12792 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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TWF1Q12792 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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