Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms