Protein–RNA interactions for Protein: Q05932

FPGS, Folylpolyglutamate synthase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FPGSQ05932 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FPGSQ05932 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FPGSQ05932 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FPGSQ05932 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FPGSQ05932 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FPGSQ05932 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FPGSQ05932 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FPGSQ05932 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FPGSQ05932 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FPGSQ05932 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FPGSQ05932 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FPGSQ05932 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FPGSQ05932 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FPGSQ05932 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FPGSQ05932 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FPGSQ05932 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FPGSQ05932 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FPGSQ05932 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FPGSQ05932 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FPGSQ05932 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FPGSQ05932 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FPGSQ05932 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FPGSQ05932 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FPGSQ05932 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FPGSQ05932 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FPGSQ05932 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FPGSQ05932 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FPGSQ05932 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FPGSQ05932 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FPGSQ05932 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FPGSQ05932 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FPGSQ05932 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FPGSQ05932 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FPGSQ05932 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FPGSQ05932 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FPGSQ05932 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FPGSQ05932 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FPGSQ05932 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FPGSQ05932 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
FPGSQ05932 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FPGSQ05932 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
FPGSQ05932 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FPGSQ05932 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FPGSQ05932 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FPGSQ05932 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FPGSQ05932 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FPGSQ05932 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FPGSQ05932 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FPGSQ05932 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FPGSQ05932 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
FPGSQ05932 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FPGSQ05932 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
FPGSQ05932 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FPGSQ05932 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FPGSQ05932 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FPGSQ05932 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FPGSQ05932 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FPGSQ05932 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FPGSQ05932 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FPGSQ05932 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
FPGSQ05932 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FPGSQ05932 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FPGSQ05932 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FPGSQ05932 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FPGSQ05932 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
FPGSQ05932 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FPGSQ05932 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FPGSQ05932 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FPGSQ05932 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FPGSQ05932 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FPGSQ05932 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FPGSQ05932 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FPGSQ05932 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FPGSQ05932 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FPGSQ05932 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FPGSQ05932 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FPGSQ05932 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FPGSQ05932 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FPGSQ05932 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FPGSQ05932 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FPGSQ05932 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FPGSQ05932 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FPGSQ05932 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FPGSQ05932 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FPGSQ05932 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FPGSQ05932 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FPGSQ05932 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FPGSQ05932 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FPGSQ05932 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FPGSQ05932 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FPGSQ05932 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FPGSQ05932 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FPGSQ05932 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FPGSQ05932 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FPGSQ05932 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FPGSQ05932 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FPGSQ05932 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FPGSQ05932 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FPGSQ05932 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FPGSQ05932 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms