Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms