Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARDQ03181 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms