Protein–RNA interactions for Protein: Q02297

NRG1, Pro-neuregulin-1, membrane-bound isoform, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG1Q02297 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms