Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms