Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms