Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms