Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
RPS29P62273 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
RPS29P62273 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
RPS29P62273 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
RPS29P62273 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
RPS29P62273 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
RPS29P62273 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
RPS29P62273 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
RPS29P62273 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
RPS29P62273 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
RPS29P62273 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
RPS29P62273 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RPS29P62273 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RPS29P62273 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
RPS29P62273 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
RPS29P62273 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
RPS29P62273 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
RPS29P62273 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RPS29P62273 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
RPS29P62273 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
RPS29P62273 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
RPS29P62273 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
RPS29P62273 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RPS29P62273 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
RPS29P62273 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
RPS29P62273 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
RPS29P62273 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
RPS29P62273 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
RPS29P62273 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
RPS29P62273 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
RPS29P62273 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
RPS29P62273 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
RPS29P62273 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
RPS29P62273 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
RPS29P62273 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RPS29P62273 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
RPS29P62273 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
RPS29P62273 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RPS29P62273 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RPS29P62273 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RPS29P62273 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
RPS29P62273 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RPS29P62273 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
RPS29P62273 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RPS29P62273 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RPS29P62273 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RPS29P62273 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RPS29P62273 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RPS29P62273 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RPS29P62273 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RPS29P62273 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RPS29P62273 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RPS29P62273 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RPS29P62273 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
RPS29P62273 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
RPS29P62273 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
RPS29P62273 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RPS29P62273 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RPS29P62273 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RPS29P62273 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
RPS29P62273 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
RPS29P62273 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
RPS29P62273 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
RPS29P62273 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
RPS29P62273 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
RPS29P62273 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RPS29P62273 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
RPS29P62273 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RPS29P62273 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RPS29P62273 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RPS29P62273 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
RPS29P62273 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
RPS29P62273 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
RPS29P62273 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RPS29P62273 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
RPS29P62273 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RPS29P62273 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RPS29P62273 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
RPS29P62273 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RPS29P62273 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RPS29P62273 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
RPS29P62273 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
RPS29P62273 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
RPS29P62273 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
RPS29P62273 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
RPS29P62273 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
RPS29P62273 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
RPS29P62273 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
RPS29P62273 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
RPS29P62273 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
RPS29P62273 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
RPS29P62273 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
RPS29P62273 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
RPS29P62273 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
RPS29P62273 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
RPS29P62273 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
RPS29P62273 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
RPS29P62273 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
RPS29P62273 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
RPS29P62273 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms