Protein–RNA interactions for Protein: P55055

NR1H2, Oxysterols receptor LXR-beta, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H2P55055 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NR1H2P55055 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms