Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms