Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms