Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms