Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA3P32297 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms