Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX2P28328 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX2P28328 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX2P28328 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX2P28328 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX2P28328 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX2P28328 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX2P28328 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX2P28328 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX2P28328 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX2P28328 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX2P28328 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX2P28328 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX2P28328 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX2P28328 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX2P28328 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX2P28328 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX2P28328 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX2P28328 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX2P28328 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX2P28328 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX2P28328 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX2P28328 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX2P28328 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX2P28328 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX2P28328 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX2P28328 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX2P28328 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX2P28328 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX2P28328 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX2P28328 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX2P28328 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX2P28328 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX2P28328 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX2P28328 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX2P28328 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX2P28328 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX2P28328 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX2P28328 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX2P28328 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX2P28328 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX2P28328 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX2P28328 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX2P28328 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX2P28328 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX2P28328 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX2P28328 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX2P28328 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX2P28328 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX2P28328 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX2P28328 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX2P28328 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX2P28328 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX2P28328 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX2P28328 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX2P28328 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX2P28328 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX2P28328 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX2P28328 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX2P28328 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX2P28328 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX2P28328 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX2P28328 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX2P28328 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX2P28328 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX2P28328 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX2P28328 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX2P28328 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX2P28328 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX2P28328 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX2P28328 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX2P28328 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX2P28328 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX2P28328 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX2P28328 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX2P28328 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX2P28328 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX2P28328 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX2P28328 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX2P28328 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX2P28328 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX2P28328 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX2P28328 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX2P28328 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX2P28328 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX2P28328 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX2P28328 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX2P28328 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX2P28328 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX2P28328 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX2P28328 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX2P28328 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX2P28328 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX2P28328 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX2P28328 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX2P28328 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX2P28328 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX2P28328 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX2P28328 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX2P28328 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms