Protein–RNA interactions for Protein: P27695

APEX1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX1P27695 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APEX1P27695 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
APEX1P27695 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APEX1P27695 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APEX1P27695 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APEX1P27695 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APEX1P27695 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APEX1P27695 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APEX1P27695 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APEX1P27695 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APEX1P27695 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APEX1P27695 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APEX1P27695 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APEX1P27695 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APEX1P27695 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APEX1P27695 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APEX1P27695 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APEX1P27695 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APEX1P27695 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APEX1P27695 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APEX1P27695 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
APEX1P27695 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APEX1P27695 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APEX1P27695 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APEX1P27695 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APEX1P27695 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APEX1P27695 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APEX1P27695 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
APEX1P27695 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APEX1P27695 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APEX1P27695 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APEX1P27695 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APEX1P27695 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APEX1P27695 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APEX1P27695 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APEX1P27695 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APEX1P27695 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APEX1P27695 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APEX1P27695 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APEX1P27695 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APEX1P27695 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APEX1P27695 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APEX1P27695 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APEX1P27695 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APEX1P27695 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APEX1P27695 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APEX1P27695 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APEX1P27695 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APEX1P27695 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APEX1P27695 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APEX1P27695 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APEX1P27695 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APEX1P27695 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APEX1P27695 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APEX1P27695 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APEX1P27695 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APEX1P27695 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APEX1P27695 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APEX1P27695 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APEX1P27695 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APEX1P27695 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APEX1P27695 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APEX1P27695 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APEX1P27695 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APEX1P27695 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APEX1P27695 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APEX1P27695 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APEX1P27695 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APEX1P27695 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APEX1P27695 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APEX1P27695 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APEX1P27695 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APEX1P27695 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APEX1P27695 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APEX1P27695 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APEX1P27695 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APEX1P27695 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APEX1P27695 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APEX1P27695 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APEX1P27695 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APEX1P27695 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APEX1P27695 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APEX1P27695 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APEX1P27695 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APEX1P27695 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
APEX1P27695 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
APEX1P27695 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
APEX1P27695 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
APEX1P27695 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
APEX1P27695 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
APEX1P27695 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
APEX1P27695 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
APEX1P27695 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
APEX1P27695 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
APEX1P27695 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
APEX1P27695 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
APEX1P27695 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
APEX1P27695 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
APEX1P27695 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
APEX1P27695 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms