Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms