Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms