Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPHA1P21709 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms