Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL2P19875 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms