Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPI1P17947 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPI1P17947 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPI1P17947 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPI1P17947 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPI1P17947 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPI1P17947 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPI1P17947 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SPI1P17947 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPI1P17947 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPI1P17947 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPI1P17947 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPI1P17947 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPI1P17947 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPI1P17947 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPI1P17947 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPI1P17947 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPI1P17947 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SPI1P17947 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPI1P17947 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SPI1P17947 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPI1P17947 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPI1P17947 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SPI1P17947 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPI1P17947 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPI1P17947 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPI1P17947 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SPI1P17947 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPI1P17947 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SPI1P17947 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SPI1P17947 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPI1P17947 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPI1P17947 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPI1P17947 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SPI1P17947 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPI1P17947 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPI1P17947 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPI1P17947 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPI1P17947 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPI1P17947 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPI1P17947 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPI1P17947 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPI1P17947 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPI1P17947 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPI1P17947 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPI1P17947 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPI1P17947 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPI1P17947 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPI1P17947 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPI1P17947 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPI1P17947 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPI1P17947 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPI1P17947 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPI1P17947 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPI1P17947 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPI1P17947 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPI1P17947 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPI1P17947 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPI1P17947 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SPI1P17947 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPI1P17947 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPI1P17947 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPI1P17947 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPI1P17947 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPI1P17947 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPI1P17947 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPI1P17947 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPI1P17947 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPI1P17947 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPI1P17947 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SPI1P17947 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SPI1P17947 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SPI1P17947 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SPI1P17947 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPI1P17947 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPI1P17947 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPI1P17947 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SPI1P17947 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SPI1P17947 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPI1P17947 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPI1P17947 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPI1P17947 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPI1P17947 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPI1P17947 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPI1P17947 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPI1P17947 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPI1P17947 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPI1P17947 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPI1P17947 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPI1P17947 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPI1P17947 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPI1P17947 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPI1P17947 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPI1P17947 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPI1P17947 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPI1P17947 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPI1P17947 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SPI1P17947 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPI1P17947 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPI1P17947 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms