Protein–RNA interactions for Protein: P17301

ITGA2, Integrin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA2P17301 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms