Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CTLA4P16410 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CTLA4P16410 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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