Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSD2O96028 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSD2O96028 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSD2O96028 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSD2O96028 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSD2O96028 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSD2O96028 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSD2O96028 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSD2O96028 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSD2O96028 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSD2O96028 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSD2O96028 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSD2O96028 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NSD2O96028 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NSD2O96028 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NSD2O96028 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NSD2O96028 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NSD2O96028 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NSD2O96028 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NSD2O96028 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NSD2O96028 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NSD2O96028 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NSD2O96028 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NSD2O96028 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NSD2O96028 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NSD2O96028 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NSD2O96028 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NSD2O96028 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NSD2O96028 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NSD2O96028 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NSD2O96028 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSD2O96028 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSD2O96028 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSD2O96028 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSD2O96028 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSD2O96028 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSD2O96028 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NSD2O96028 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSD2O96028 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSD2O96028 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSD2O96028 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSD2O96028 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NSD2O96028 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSD2O96028 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSD2O96028 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSD2O96028 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSD2O96028 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSD2O96028 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSD2O96028 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSD2O96028 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSD2O96028 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSD2O96028 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSD2O96028 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSD2O96028 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSD2O96028 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSD2O96028 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSD2O96028 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSD2O96028 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSD2O96028 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSD2O96028 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSD2O96028 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSD2O96028 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSD2O96028 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSD2O96028 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSD2O96028 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSD2O96028 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSD2O96028 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSD2O96028 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSD2O96028 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSD2O96028 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSD2O96028 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSD2O96028 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSD2O96028 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSD2O96028 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSD2O96028 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSD2O96028 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSD2O96028 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSD2O96028 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSD2O96028 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSD2O96028 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSD2O96028 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSD2O96028 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSD2O96028 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSD2O96028 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSD2O96028 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSD2O96028 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSD2O96028 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSD2O96028 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSD2O96028 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSD2O96028 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSD2O96028 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSD2O96028 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSD2O96028 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSD2O96028 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSD2O96028 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSD2O96028 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NSD2O96028 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSD2O96028 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NSD2O96028 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSD2O96028 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms