Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms