Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

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Length 872 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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