Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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HOXA3O43365 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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