Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms