Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI40

SLC24A2, Sodium/potassium/calcium exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A2Q9UI40 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC24A2Q9UI40 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms