Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms