Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DNAJC28Q9NX36 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DNAJC28Q9NX36 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DNAJC28Q9NX36 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DNAJC28Q9NX36 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DNAJC28Q9NX36 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DNAJC28Q9NX36 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
DNAJC28Q9NX36 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DNAJC28Q9NX36 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DNAJC28Q9NX36 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DNAJC28Q9NX36 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
DNAJC28Q9NX36 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DNAJC28Q9NX36 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DNAJC28Q9NX36 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
DNAJC28Q9NX36 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
DNAJC28Q9NX36 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DNAJC28Q9NX36 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DNAJC28Q9NX36 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DNAJC28Q9NX36 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DNAJC28Q9NX36 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DNAJC28Q9NX36 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DNAJC28Q9NX36 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DNAJC28Q9NX36 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DNAJC28Q9NX36 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DNAJC28Q9NX36 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DNAJC28Q9NX36 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DNAJC28Q9NX36 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DNAJC28Q9NX36 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DNAJC28Q9NX36 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DNAJC28Q9NX36 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DNAJC28Q9NX36 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNAJC28Q9NX36 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNAJC28Q9NX36 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNAJC28Q9NX36 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNAJC28Q9NX36 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNAJC28Q9NX36 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNAJC28Q9NX36 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNAJC28Q9NX36 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNAJC28Q9NX36 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNAJC28Q9NX36 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNAJC28Q9NX36 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNAJC28Q9NX36 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNAJC28Q9NX36 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNAJC28Q9NX36 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNAJC28Q9NX36 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNAJC28Q9NX36 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNAJC28Q9NX36 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNAJC28Q9NX36 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms