Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms