Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD26

GOPC, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOPCQ9HD26 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GOPCQ9HD26 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GOPCQ9HD26 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GOPCQ9HD26 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GOPCQ9HD26 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
GOPCQ9HD26 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GOPCQ9HD26 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GOPCQ9HD26 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
GOPCQ9HD26 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GOPCQ9HD26 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GOPCQ9HD26 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GOPCQ9HD26 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GOPCQ9HD26 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GOPCQ9HD26 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GOPCQ9HD26 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GOPCQ9HD26 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GOPCQ9HD26 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GOPCQ9HD26 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GOPCQ9HD26 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOPCQ9HD26 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOPCQ9HD26 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOPCQ9HD26 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOPCQ9HD26 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOPCQ9HD26 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOPCQ9HD26 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOPCQ9HD26 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOPCQ9HD26 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOPCQ9HD26 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOPCQ9HD26 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOPCQ9HD26 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOPCQ9HD26 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOPCQ9HD26 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOPCQ9HD26 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOPCQ9HD26 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOPCQ9HD26 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOPCQ9HD26 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOPCQ9HD26 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GOPCQ9HD26 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GOPCQ9HD26 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOPCQ9HD26 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOPCQ9HD26 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOPCQ9HD26 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOPCQ9HD26 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOPCQ9HD26 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GOPCQ9HD26 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOPCQ9HD26 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GOPCQ9HD26 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOPCQ9HD26 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GOPCQ9HD26 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOPCQ9HD26 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOPCQ9HD26 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOPCQ9HD26 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOPCQ9HD26 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOPCQ9HD26 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOPCQ9HD26 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOPCQ9HD26 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOPCQ9HD26 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOPCQ9HD26 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOPCQ9HD26 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOPCQ9HD26 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOPCQ9HD26 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOPCQ9HD26 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOPCQ9HD26 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOPCQ9HD26 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOPCQ9HD26 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOPCQ9HD26 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOPCQ9HD26 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOPCQ9HD26 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOPCQ9HD26 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOPCQ9HD26 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOPCQ9HD26 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOPCQ9HD26 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOPCQ9HD26 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOPCQ9HD26 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOPCQ9HD26 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOPCQ9HD26 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
GOPCQ9HD26 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOPCQ9HD26 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOPCQ9HD26 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOPCQ9HD26 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOPCQ9HD26 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOPCQ9HD26 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOPCQ9HD26 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOPCQ9HD26 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOPCQ9HD26 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOPCQ9HD26 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOPCQ9HD26 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms