Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7N4

SCAF1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF1Q9H7N4 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 YY1P1-201ENST00000427625 668 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 CSNK1A1-209ENST00000606299 1075 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 AC005529.1-201ENST00000411969 289 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCAF1Q9H7N4 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCAF1Q9H7N4 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCAF1Q9H7N4 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCAF1Q9H7N4 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCAF1Q9H7N4 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCAF1Q9H7N4 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCAF1Q9H7N4 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms