Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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