Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM5Q9C035 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms