Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms