Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW7

SYT17, Synaptotagmin-17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT17Q9BSW7 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYT17Q9BSW7 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYT17Q9BSW7 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYT17Q9BSW7 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYT17Q9BSW7 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SYT17Q9BSW7 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYT17Q9BSW7 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYT17Q9BSW7 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYT17Q9BSW7 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYT17Q9BSW7 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYT17Q9BSW7 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYT17Q9BSW7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYT17Q9BSW7 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYT17Q9BSW7 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYT17Q9BSW7 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYT17Q9BSW7 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYT17Q9BSW7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYT17Q9BSW7 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYT17Q9BSW7 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYT17Q9BSW7 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SYT17Q9BSW7 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYT17Q9BSW7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYT17Q9BSW7 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYT17Q9BSW7 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYT17Q9BSW7 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYT17Q9BSW7 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYT17Q9BSW7 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYT17Q9BSW7 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYT17Q9BSW7 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYT17Q9BSW7 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYT17Q9BSW7 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYT17Q9BSW7 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SYT17Q9BSW7 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SYT17Q9BSW7 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYT17Q9BSW7 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYT17Q9BSW7 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYT17Q9BSW7 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SYT17Q9BSW7 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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