Protein–RNA interactions for Protein: Q99674

CGREF1, Cell growth regulator with EF hand domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGREF1Q99674 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms