Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms