Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms