Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARXQ96QS3 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms