Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms